Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn1P18608 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms