Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-6P18531 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms