Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18530 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18530 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18530 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18530 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18530 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18530 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18530 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18530 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18530 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18530 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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