Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl9P18340 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl9P18340 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl9P18340 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms