Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms