Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f1P17208 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f1P17208 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f1P17208 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f1P17208 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f1P17208 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f1P17208 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms