Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms