Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms