Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms