Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rag1P15919 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rag1P15919 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms