Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trim30aP15533 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim30aP15533 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms