Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd79bP15530 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms