Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmnb1P14733 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmnb1P14733 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms