Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Dnmt1P13864 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dnmt1P13864 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms