Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FosbP13346 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FosbP13346 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FosbP13346 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FosbP13346 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FosbP13346 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FosbP13346 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FosbP13346 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FosbP13346 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FosbP13346 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FosbP13346 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FosbP13346 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FosbP13346 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FosbP13346 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms