Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkar1bP12849 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms