Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms