Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms