Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa5P09021 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa5P09021 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms