Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms