Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms