Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms