Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SparcP07214 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SparcP07214 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SparcP07214 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SparcP07214 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SparcP07214 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SparcP07214 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SparcP07214 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SparcP07214 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SparcP07214 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SparcP07214 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SparcP07214 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SparcP07214 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SparcP07214 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms