Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06335 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06335 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06335 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06335 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06335 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06335 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06335 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06335 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06335 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06335 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms