Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-V1P06325 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms