Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04212 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04212 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04212 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04212 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P04212 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P04212 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04212 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P04212 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms