Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GzmbP04187 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms