Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a1P02463 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a1P02463 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a1P02463 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms