Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms