Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01746 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01746 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01746 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01746 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01746 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01746 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01746 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01746 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01746 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01746 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms