Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01658 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01658 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01658 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01658 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01658 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01658 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01658 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01658 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01658 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01658 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms