Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01655 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01655 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01655 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01655 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01655 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01655 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01655 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01655 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01655 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms