Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CpdO89001 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CpdO89001 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CpdO89001 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CpdO89001 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CpdO89001 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CpdO89001 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CpdO89001 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CpdO89001 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CpdO89001 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CpdO89001 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CpdO89001 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms