Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms