Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcnkO88874 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms