Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops3O88543 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops3O88543 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms