Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms