Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nid2O88322 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nid2O88322 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms