Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfdp1O88271 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms