Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx7O70439 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms