Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd70O55237 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd70O55237 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms