Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms