Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtogO55225 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtogO55225 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtogO55225 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtogO55225 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtogO55225 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtogO55225 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OtogO55225 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtogO55225 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtogO55225 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms