Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb2O55203 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb2O55203 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms