Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp10O55123 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp10O55123 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms