Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrxO55103 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrxO55103 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrxO55103 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrxO55103 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrxO55103 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrxO55103 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrxO55103 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrxO55103 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrxO55103 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrxO55103 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrxO55103 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrxO55103 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrxO55103 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms