Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms