Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole2O54956 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole2O54956 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms