Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6bO54951 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms