Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TsksO54887 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TsksO54887 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TsksO54887 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TsksO54887 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TsksO54887 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TsksO54887 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TsksO54887 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TsksO54887 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TsksO54887 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TsksO54887 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms